Вес, габариты, материал изготовления. Маркетинговая ниша. 600D - обновление 550-ого. Существует мнение, что 600D - это маленький 60D. Удачный аппарат, как и 60D. 60D практичнее, как танк практичнее джипа. Но и минусы соответствующие.
Вы их оба в руках подержите и сделайте окончательный выбор. Да, если в магазине не будет 600-ого, подержите 550-ый, по габаритам и весу почти одно и то же.