если дом зарегистрируют, то тем самым это будет узаконено. Как кадастр... уж если зарегистрировано и соседи подписали, то потом что-то доказывать. даже если границы участка нарушают нечто - намного сложнее! Как минимум претензии можно будет переложить на плечи зарегистрировавшего органа, т.е. получить решение о сносе будет значительно труднее...
Кстати, не знаю про участки ИЖС, но в садоводствах вроде 1 метр от границы. Иначе на участках в 6 соток помещались бы только вышки посередине