если у вас инфекция как-то себя проявляет, то, думаю, лечить надо. Если же просто зафиксировали ее наличие - вопрос неоднозначный, может посмотреть титр (в посеве?), есть такое мнение врачей, что лечить надо при титре выше 10х4, но тоже никогда не могла найти информации по поводу того кто и на каком основании именно этот титр берет за "точку отсчета"?
есть вот такой ресурс, мне он кажется разумным. Почитайте, может там найдете стоящую информацию
http://venuro.info
антибиотики - смотря какие, считается, что пенециллиновый ряд безопасен при беременности. Например, при стрептококковой инфекции теже западные врачи в США всех беременных в 37 недель профилактически пролечивают амоксиклавом (просто так сложилось, что про стреп я знаю больше, чем про уреаплазму)))